清净寺门楼仿照叙利亚大马士革伊斯兰形式建造，大门用青、白两色花岗石精雕三层穹形尖拱顶，层层缩进，顶盖采用中国传统的莲花图案，表示伊斯兰教崇尚圣洁清净。王雄 摄

2006年，阿曼驻华大使到清净寺参观后，将清净寺想建新礼拜堂的意愿转达于阿曼国王。尔后，阿曼苏丹卡布斯捐资在清净寺东侧兴建新礼拜堂，2009年竣工，形制模仿奉天坛，可容纳500多人。图为新礼拜堂。王雄摄