两年后，施琅攻打澎湖，获知郑克塽确定投降的消息后，英国东印度公司驻台湾商馆人员很紧张，几次派人到澎湖和施琅商谈。施琅签发一纸命令，让他们张贴在商馆墙上，以免遭到清朝士兵侵扰。

施琅画像

施琅原名施郎，福建晋江人。早年是郑芝龙的部将，曾随之降清；后投靠郑成功，担任左先锋，因父亲与兄弟为郑成功所杀，1651年再次降清，是明郑降将中主张用武力剿灭郑氏最激烈者，但不受重视。直到1681年，康熙皇帝成年主政后，采纳姚启圣和李光地的建议，起用施琅出任福建水师提督一职，1683年出征台湾。(第18代孙施永龙先生提供)

等到施琅来台湾后，先是威胁英国人违法供给武器弹药给郑经、对清朝皇帝抱有敌意，要将他们下狱；要英国人缴出目前存放于商馆的全部商品明细，且须缴纳一笔不菲的佣金，他就会向清政府说好话免去他们的罪行，而康熙皇帝若想跟任何欧洲人从事交易，英国人也能通过他享受到利益；但若英国人拒绝，就没收一切财产，把他们交由朝廷处置。基于恐惧，英国商馆人员只好乖乖奉上这笔佣金。

郑克塽率众回到中国大陆后，施琅参与了台湾善后处理事务，开始筹划让英国东印度公司在福建筹设商馆，为了隐瞒英、郑双方通商的事实，施琅命手下拟了一封信说这些英国商馆人员是海难中漂流到厦门的，之后逃抵台湾，生活很辛苦。他要求英国商馆人员在信上签名，以便送交康熙皇帝。

施琅让福建总督姚启圣将这封信转给康熙皇帝，再让英国人以感谢救助为由，通过福建向北京朝贡。最终待北京认可，建立合法的贸易关系。

这个计谋却遭到姚启圣反对，加上后来康熙确定开放海禁，派遣户部人员前来管理税务机关，施琅连忙将已重返厦门开设商馆的英国人赶走，英国人一离开商馆，原地立即转设为厦门税务机关，以掩盖施琅走私贸易的事实。

最后，英国东印度公司不但没有讨回郑经积欠的庞大债务，厦门和台湾的商馆又被清军占据，在台湾开设12年的英国商馆在1684年封馆，被迫撤离。

英国既然通过郑经到了厦门，并打开与中国贸易的大门，到口的肥肉当然不会轻易放弃，因此仍继续在厦门、广州和澳门寻找做生意的机会。英国的台湾商馆封馆15年后，英国商船迈克莱斯菲号终于到了广州，直接将中国的丝、茶和瓷器出口到欧洲，后来更在广州设立商馆11，定期贸易期间，英国商人被允许长住广州，非贸易期间则居住在澳门。

18世纪20年代前后，茶叶取代丝织品，成为中国第一大出口商品，英国东印度公司则全力经营茶叶的出口。18世纪中叶，英国在中国的贸易量已超过了西方各国的总和。

有了国家力量的支持，英国持续扩大在中国的贸易量，甚至走私鸦片，后来因钦差大臣林则徐销毁英国商人的鸦片，英国对中国发动鸦片战争；清朝政府战败后，香港岛成为英国殖民地。战后，西方列强跟随着英国的脚步，开始不客气地蚕食鲸吞中国领土。