在李玮峰国家队生涯中首度染红发生在1999年的登喜路杯，对手是韩国队。下半时开场仅4分钟，韩国队从右路开出角球，李玮峰跳起将球顶出，不过在起跳时手击打在韩国队最有威胁的射手李东国脸上，李东国随即用肘部反击，李玮峰起身后便上去与之理论，李东国立即倒地，结果两人双双被罚离场。

在2001年十强赛中国男足主场对阵乌兹别克斯坦的比赛中，李玮峰头球破门后跑到场边跪倒在地双手指天，告慰自己的父亲李枫梧的在天之灵。2000年，李枫梧因一场车祸不幸离世，从很小的时候李玮峰就是家里唯一的顶梁柱。