“我体会，反腐倡廉必须坚持惩治和预防两手抓、两手都要硬，在坚决惩治的同时实施有效预防是反腐倡廉建设的必由之路。”

2012年履新中纪委后，陈文清曾重点负责机关改革和针对纪检系统自身的监督工作。

2014年3月，中纪委监察部机关进行机构改革，整合6个内设机构，新设3个内设机构，重新组建2个内设机构。并增加了纪检监察干部监督室，专门负责对纪检监察干部的监督。

在接受采访时，陈文清曾对此举作出解读。他表示，目前反腐败形势依然严峻和复杂。只有通过深化改革，转变职能，强化监督，才能更好地履行纪检监察监督执纪问责的职责，努力实现治理能力的现代化。

“正人先正己，只有自身过硬，才能履行好监督别人的职责。”他表示，增设纪检监察干部监督室，正是为了加大对纪检监察干部违纪违法行为的查处力度，加强对纪检监察系统自身的监督，防止队伍内部出现“蛀虫”，及时把“害群之马”清理出去。

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“政事儿”注意到，同年12月，陈文清曾透露，干部监督室成立不到1年，已将立案查处的3名纪检监察领导干部开除党籍、开除公职，并移送司法机关处理。

此外，中纪委副书记任上的陈文清还参与了中纪委派驻机构改革工作。2014年12月，中央决定在中办、中组部、中宣部等7部门新设中纪委派驻机构，此举引发舆论广泛关注。

陈文清对此表示，中央和国家机关是党和国家治理体系的中枢，权力集中、地位重要，近年来发生的一些腐败案件造成了恶劣社会影响，加强监督非常必要和迫切。

中纪委时期，陈文清还同时兼任其他职务。

2014年3月1日，他曾以中国纪检监察学院院长身份出席学院春季学期开学典礼。同年12月24日，陈文清首次以纪律检查体制改革专项小组副组长身份亮相。

在中纪委工作两年半之后，2015年4月，陈文清不再担任中纪委副书记一职，并重新回到了自己早年从事的政法领域。

5个月后，他首次以国安部党委书记的身份露面，耿惠昌则继续留任国安部部长。

国家行政学院教授汪玉凯在接受媒体采访时曾表示，陈文清由纪检部门转岗国安部，或与高层加强国安工作以及国安系统的纠偏有关。

2015年1月，国安部原副部长马建因涉嫌严重违纪违法被查。

4个月后，全国国家安全机关总结表彰大会在北京召开，习近平出席大会并讲话，他提出，要努力打造一支“坚定纯洁、让党放心、甘于奉献、能拼善赢”的干部队伍。

这16字随后成为国安系统工作的指导方针。